生命活动是机体与环境之间作用的结果，时刻需要物质、能量和信息的交换。中医学注重机体与环境的关系，以及整体与局部的关系，认为疾病是机体内部的不平衡状态与外界环境变化不同步，适应力不足出现的结果。现代医学大多注重观察形态的、微观的病变，要查找病源微生物。它否定了这种关系的存在，是孤立的、割裂的，把观察不到的就当不存在。结果出现了中医和西医看待疾病的“原点”不同。
在处理畜禽与外界环境关系的把握（提高机体适应力）上，传统中兽医体现出优势。中兽医注重环境对机体的影响，发现机体整体应对变化能力的不足，针对各脏器功能配合的异常或是不平衡，来选择合适的中药来组方，多靶点多角度协调机体内部关系。从生命规律出发，哪个地方升一升，哪个地方降一降，哪个地方该重点强化，使用中药对整体的功能活动进行调节，提高生命活动对环境变化的适应能力，来预防和治疗疾病。
传统中兽医注重协调机体五脏之间的关系，来组方和使用中药。中医理论中肝肺是气机升降的外轮，肝气升肺气降，机体气机运行上需要相反相成，相互制约，谁都不要太过或不及。中药桑菊饮是治疗畜禽风热犯肺，有咳嗽等症状经典方剂。可以疏散风热、止咳的中药很多，君药偏用桑叶和菊花是有原因的。因为只有桑叶菊花能走肝、肺两经，既能清肺肃肺，又能清肝平肝，两脏关系协调得好，来达成肺气肃降的目标。在家禽发生风热感冒，影响肺气的宣降，导致肺热咳喘，解剖家禽肺背面发黑出血的情况时，在用中药清肺热，配上养肝阴，抑制肝火上亢的中药丙冬甘宁，治疗效果就比一种中药要好。这样的例子还有很多。
传统中兽医注意顾护中焦脾胃，发挥其根据地、大本营的作用，让康复有保障。桂枝汤是中医药的万方之祖，也是治疗畜禽风寒表虚证，营卫不和的经典方剂，其组方成就最高，对后世的临床实践有指导价值。桂枝汤的组成除了桂枝和芍药外，还有生姜、大枣、甘草，后三种都是养脾胃的药。桂枝汤先要顾护胃脾，促使其吸收的水谷精微向体表输送。桂枝芍药有了后方的支援，一放一收，促进血液循环加速运行，使体表营卫和睦，祛邪外出。在五行之中，土生金，脾肺是母子关系，脾气强了肺气强，能量的输布能力强，机体适应力也强。脾胃是根本，所以畜禽生病了首先要观察脾胃，一旦采食不好的，要用健脾和提高畜禽采食的中药（裨卫建）。脾胃一虚，百病由生，起病初不要一开始使用寒凉或泻下的药，避免伤及脾胃或引邪入里。一定要特别注意。
中兽医治疗疾病要以病程的变化为依据，是辨证论治的核心。疾病是正气和邪气抗争的过程，所以一般病都是一点端倪演化来的。生病起于过用。应激包括温差变化等因素是畜禽发病的诱因，其引发的微循环障碍，供能不平衡，引发了疾病。应激或有环境变化前需要用振奋畜禽代谢水平，改善微循环的中药来预防，疾病就能大幅减少。按发病阶段选不同性味中药治疗。病症发生在上焦，有怕冷发烧的咳喘的，一定要用能发表、清透，轻清得走气分的中药，祛散邪气；机体正邪抗争激烈或热象重的，可用寒凉重剂，辅助养阴；病在血分的，出血多，组织病变的要用走血份养阴的药，同时要调畅气机，不忘固阳摄阴。
所以，传统中兽医把握整体的观点看待疾病，机体和环境是一体的。防治疾病就是协调内部关系和配合力，与外界变化相适应。中医理论为指导，强化中药材的使用效果（炮制、组方、加工、应用等）。我们把机体比作一个企业，企业出了问题，就是要找出企业不顺应市场的内部原因，并针对不同的原因采取不同的方法。疾病的外因就是企业对变化的不适应，内因则是整体在管理上低效和无序。疾病是整体的“管理”失控造成的，治疗需要恢复整体的管理，而不要破坏，从内部做调整，达成适应新变化的能力。
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